单孔亚纲的演化史

始祖单弓兽（Archaeothyris）与Clepsydrops最早的单弓类动物。它们属于盘龙目，存活于石炭纪的宾夕法尼亚纪。盘龙目是第一群成功的羊膜动物，散布并多样化发展直到它们成为晚石炭纪到早二叠纪陆地上的优势动物。它们通常被分为两支：真盘龙亚目、卡色龙亚目。它们体积庞大、四肢成躺卧状态、冷血、小的大脑。它们是那个时代陆地上最大的动物，可达3米(10呎)长。有些像是异齿龙，拥有大型帆状物可以帮助提升他们体温。少数残存的类群存活到二叠纪晚期。

兽孔目是一群更为进步的单弓类动物，出现在二叠纪前半段，并且成为二叠纪后半段陆地上的优势动物。它们成为优势动物两次：一次在二叠纪，一次在新生代。它们是到二叠纪中期到晚期为止最多样性与大量生存的动物，包括草食性、肉食性，体型从小如老鼠(例：罗伯特兽)，体型大的可以以公吨计算(例：麝足兽)。在繁荣了数百万年之后，这些成功的动物几乎因为2亿5百万年前的二叠纪-三叠纪灭绝事件而灭绝了，这个地球历史上最大的生物灭绝事件，可能跟西伯利亚地盾火山爆发事件有关。

没有盘龙目，只有少数兽孔目在二叠纪-三叠纪灭绝事件中存活下来，并且成功在三叠纪存活者；包括:水龙兽、犬颌兽，后者出现在早三叠纪晚期，它们与早期祖龙类(原先被认知为槽齿目，这项目不在现代分类中使用)同时存在。有些早期祖龙，如派克鳄，是小型而轻快的；其他如：引鳄，可以比最大的兽孔目生物还大。

三叠纪的兽孔目包括三个生物群：喙状嘴的草食性二齿兽类(例如：水龙兽与它的后代肯氏兽)，有些成员可身长到以公吨计算。越来越类似哺乳类的犬齿兽类，分草食性、肉食性、食虫性，包括出现在奥伦尼克阶的真犬齿兽类，早期的代表是犬颌兽。最后是兽头类，仅存活到早三叠纪。

在三叠纪里，跟仍然体积大的二齿兽类不一样，犬齿兽类逐渐的变小并且更类似哺乳类。最小最进化的犬齿兽类只有鼩鼱般大小，在晚三叠纪的卡尼克阶，大约2亿2千万年前，成为哺乳类最早的祖先。

随者早期兽孔目到犬齿兽类到真犬齿兽类到哺乳类的成功进化，主要的下颚骨，取代了邻近的骨头。所以，下颚逐渐形成只有一个大型骨头，几块小型的下颚骨逐渐移动到内耳里，使得听觉更为复杂。

因为气候变迁、植被改变、生态竞争、或者以上总和，大部分的大型犬齿兽类(属于Traversodontidae科)与二齿兽类(肯氏兽科)，在卡尼阶时代消失，在三叠纪-侏儸纪灭绝事件消灭所有大型非恐龙类初龙前。它们的位置被双弓类初龙取代，也就是俗称的恐龙，在剩下的中生代时期成为优势陆地生态系统。存活下来的单弓动物很小，体型从鼩鼱到类似獾的强壮爬兽Repenomamus。

在侏儸纪与白垩纪期间，这些存活的非哺乳犬齿兽类非常小，例如：三瘤齿兽。没有一种犬齿兽类长得比猫还大。大多数侏儸纪与白垩纪的犬齿兽类是草食性的，有些是肉食性的。三棱齿兽科在侏儸纪末第一次出现。它们是肉食性并且存活到侏儸纪中期。另外一种，三瘤齿兽科跟三棱齿兽科同时出现，但为草食性。这生物群在早白垩纪末期灭绝。二齿兽类被认为在侏儸纪末灭绝，但还是有证据显示这生物群存活者。新的化石已在冈瓦那大陆的白垩纪岩石中发现。这是个化石记录中忽隐忽现的物种的例子。

现在，有大约4500个品种的单弓动物存活者，包括水生(鲸鱼)、飞行(蝙蝠)，还有到目前为止已知最大的生物(蓝鲸)。

单弓动物进化成哺乳类被认为是因为晚上行动，逐渐增加的恐龙在这时间并不占优势。为了在夜间生存，原始的哺乳类必须在夜间增加它们的新陈代谢率以维持体温。这意味者更快地消耗食物(一般被认为是昆虫)。为了促进快速消化，原始的哺乳类演化出咀嚼与特殊化的牙齿来协助咀嚼。脚臂也演化到身体底下而不是身体两侧。这让原始哺乳类能更快改变方向以抓住小型猎物。与快速奔跑的猎食者相比，原始哺乳类改采机动性的策略。

通过对1978-1980年澳洲西部出土的丝状化石的研究，表明大约在35亿年前，地球上便出现了原核生物。最早的原核生物可能是异养生物。在南非的岩石中所发现的化石表明，距今31-34亿年前蓝藻类（蓝细菌）开始形成。蓝藻是能够进行光合作用的原核生物。大约在20亿年前，光合作用所释放出来的氧气使大气层中开始含有氧气，这可能会导致许多厌氧生物的灭亡，但甲烷细菌以及它们的近缘种类仍然在无氧的环境中存留至今。由蓝藻和其他原核生物占优势的时代大约历时20亿年。

最早的真核生物的出现大约在距今14-15亿前。真核生物的起源是生物演化史上的一个重大事件，因为伴随着真核生物的形成，染色体、减数分裂和有性繁殖开始出现。在前寒武纪（8-6.7亿年前），真核生物中的真菌、原生动物以及藻类中的几个门便形成了，动物与植物开始出现分化。到前寒武纪结束时，腔肠动物、环节动物或节肢动物等几个动物的门开始形成。寒武纪(5.7---5.05亿年前）：在大约距今5亿9000万年前，类型丰富多样的无脊椎动物的出现标志着寒武纪的开始。在这个时期，以三叶虫为代表的节肢动物门以及腕足动物门、软体动物门、多孔动物门、棘皮动物门的许多纲开始形成。这些门类存留至今，仍然有一些种类生存下来。在距今5.1亿年前的海相沉积中，发现了最早的脊椎动物的遗迹-甲胄鱼外甲的碎片。在寒武纪时，所有动物的门都已经形成了。

奥陶纪(5.05---4.38亿年前）：许多动物的门出现适应辐射，形成了大量的纲和目。例如棘皮动物形成了21个纲，腔肠动物门中珊瑚纲也开始出现了。奥陶纪时期，无颌、无鳍的甲胄鱼大量出现并留下了完整的化石。

志留纪（距今4.38-4.08亿年前）：生物多样性增加，无颌类出现多样化。同时，有颌类中的盾皮鱼开始出现。维管植物（蕨类）和节肢动物（蝎子、多足类）开始侵入陆地。

泥盆纪（距今4.08-3.60亿年前）：珊瑚和三叶虫发生大规模的适应辐射；头足类出现。无颌类和盾皮鱼达到多样性的高峰。泥盆纪被称为鱼类的时代，软骨鱼类和硬骨鱼类陆续起源并随后发生了适应辐射。与此同时，两栖类、苔藓、维管植物（蕨类、裸子植物）和昆虫起源于这个时期。

石炭纪（距今3.60-2.86亿年前）：陆生孢子植物（蕨类）繁盛并形成大面积的森林，两栖动物的种类多样化，并出现最早的爬行类。昆虫发生适应辐射，一些原始的目（直翅目、蜚蠊目、蜉蝣目、同翅目等大量出现。二叠纪（距今2.86-2.48亿年前）：爬行动物出现适应辐射，兽孔类成为占优势的类群；昆虫的各个类群多样化，形成了蜻蜓目、半翅目、脉翅目、鞘翅目、双翅目等类群。菊石大量增殖。

三叠纪（距今2.48-2.13亿年前）：菊石第二次大规模增殖，海洋无脊椎动物的一些类群（如双壳类）的多样性增加。裸子植物开始占优势。爬行类出现适应辐射，形成了龟类、鱼龙、蛇颈龙和初龙类（进一步形成植龙、鳄类和恐龙）。早期哺乳动物出现。大陆开始漂移。

侏罗纪（距今2.13-1.44亿年前）：恐龙多样化，翼龙、雷龙、梁龙、剑龙、三角龙等种类出现。原始鸟类（始祖鸟等）出现。古代哺乳动物、裸子植物占优势。大陆继续漂移。

白垩纪（距今0.65-1.44亿年前）：大多数大陆分隔开来，恐龙继续适应辐射并在本期结束时灭绝。最早的蛇类出现并发生适应辐射。具有现代鸟类特征的黄昏鸟出现。被子植物和哺乳类开始多样化，有袋类与有胎盘类哺乳动物开始分化。第三纪（距今6500-200万年前）：被子植物大规模的多样化，并成为在森林中占优势的组成成分。昆虫发生适应辐射，并形成了大多数的现代科。脊椎动物的许多现代科已经形成。

第四纪（距今200万年前到现在）：冰川反复出现，大型哺乳动物（如剑齿虎、猛犸象、大型的美洲野牛等）绝灭，人类出现。

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